نوع همکاری : همکار
کارفرما : دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی
سال طرح : 1401
مشاهده سایر طرح های جعفر آقاجاني
پروتئین‌های PE از مسیرهای سیگنال‌دهی التهابی میزبان و مسیرهای مرگ سلولی برای گسترش پاتوژنز استفاده می‌کنند. هدف از این مطالعه بررسی ژنومیک پروتئین PE6 (RV03354) در مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم و حساس به دارو می باشد. روش کار: این مطالعه به صورت توصیفی-تحلیلی در مرکز تحقیقات مایکوباکتریولوژی پژوهشکده سل و بیماری های ریوی بیمارستان مسیح دانشوری تهران انجام گردید. ابتدا ساختار ژنومی و ترکیبات مایکوباکتریوم توبرکلوزیس حساس و مقاوم (M. tuberculosis H37Rv)، (M. tuberculosis H37Ra ) از پایگاه داده های NCBI دریافت شده و میزان جهش زایی آنها تعیین گردید. توالی های پروتئین PE6 (RV03354) نیز در مایکوباکتریوم های مورد بررسی از پایگاه PDB دریافت گردیده و جایگاه های اثر گذاری آنها مورد بررسی قرار گرفت. در مرحله بعد برهمکنش ساختار سه بعدی پروتئین PE6 (RV03354) با روش داکنینگ و با استفاده از نرم افزار دانلود Molegro Virtual Docker v6.0 مورد بررسی و تجزیه و تحلیل قرار گرفت. همچنین همردیفی توالی ها در این مطالعه با استفاده از نرم افزار MEGA6 انجام گردید. نتایج: تجزیه و تحلیل پروتئین PE6 (RV03354) در مایکوباکتریوم های مورد مطالعه چه در گونه حساس و چه در گونه مقاوم نشان داد که این پروتئین می تواند در بیماری زایی میزان نقش اساسی داشته باشد. تجزیه و تحلیل های ژنومی نشان داد که 15 SNP بر روی این پروتئین ها در مایکوباکتریوم توبرکلوزیس (M. tuberculosis H37Rv، M. tuberculosis H37Ra ) ممکن به میزان حدت و بیماری زایی آنها مرتبط باشد. مقایسه ژنومی بین سویه های H37Ra و H37Rv نشان داد که 2 SNP ،A219E (MazG) و I228M (EspK) نیز ممکن است با کاهش شدت بیماری زایی پروتئین PE6 (RV03354) در مایکوباکتریوم توبرکلوزیس H37Ra مرتبط باشد. این پروتئین PE6 (RV03354) یک مزیت مهم نسبت به سایر پروتئین های M.tb دارد و این آن است که بیماری زایی بالایی دارد و همچنین به عنوان یک مولکول فریبنده عمل می کند که اثر مولکول های دفاعی بدن را خنثی کرده و در نتیجه باعث کاهش عملکرد سیتم ایمنی بدن می شود.